Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phtf1Q9QZ09 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phtf1Q9QZ09 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phtf1Q9QZ09 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phtf1Q9QZ09 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phtf1Q9QZ09 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phtf1Q9QZ09 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phtf1Q9QZ09 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phtf1Q9QZ09 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phtf1Q9QZ09 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phtf1Q9QZ09 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phtf1Q9QZ09 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phtf1Q9QZ09 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phtf1Q9QZ09 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phtf1Q9QZ09 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms