Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clic4Q9QYB1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clic4Q9QYB1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms