Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxe3Q9QY14 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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