Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2e3Q9QXZ7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nr2e3Q9QXZ7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms