Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcsk1nQ9QXV0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms