Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rad18Q9QXK2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms