Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apbb1Q9QXJ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Apbb1Q9QXJ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms