Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkain4Q9JMG4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms