Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sfmbt1Q9JMD1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms