Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prg4Q9JM99 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg4Q9JM99 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms