Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms