Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cabp1Q9JLK7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms