Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2l2Q9JLG4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms