Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms