Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tgm1Q9JLF6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tgm1Q9JLF6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Tgm1Q9JLF6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tgm1Q9JLF6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms