Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms