Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms