Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms