Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uchl3Q9JKB1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uchl3Q9JKB1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms