Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pard6bQ9JK83 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms