Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msgn1Q9JK54 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms