Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alyref2Q9JJW6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alyref2Q9JJW6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms