Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfhx4Q9JJN2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfhx4Q9JJN2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms