Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssna1Q9JJ94 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssna1Q9JJ94 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms