Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ59

Abcb9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb9Q9JJ59 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcb9Q9JJ59 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Abcb9Q9JJ59 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Abcb9Q9JJ59 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Abcb9Q9JJ59 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Abcb9Q9JJ59 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Abcb9Q9JJ59 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Abcb9Q9JJ59 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Abcb9Q9JJ59 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcb9Q9JJ59 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcb9Q9JJ59 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcb9Q9JJ59 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcb9Q9JJ59 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Abcb9Q9JJ59 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcb9Q9JJ59 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcb9Q9JJ59 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcb9Q9JJ59 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcb9Q9JJ59 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcb9Q9JJ59 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Abcb9Q9JJ59 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Abcb9Q9JJ59 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Abcb9Q9JJ59 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Abcb9Q9JJ59 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcb9Q9JJ59 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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