Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FliiQ9JJ28 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms