Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Smad9Q9JIW5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad9Q9JIW5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms