Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2ird1Q9JI57 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2ird1Q9JI57 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms