Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Exosc9Q9JHI7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Exosc9Q9JHI7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms