Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcirg1Q9JHF5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms