Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Brd4Q9ESU6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms