Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ropn1Q9ESG2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ropn1Q9ESG2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 355.1 ms