Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ube3bQ9ES34 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ube3bQ9ES34 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms