Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SelenofQ9ERR7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SelenofQ9ERR7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SelenofQ9ERR7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SelenofQ9ERR7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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