Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlnrd1Q9ERE8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlnrd1Q9ERE8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms