Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfip11Q9ERA6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfip11Q9ERA6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms