Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cpsf1Q9EPU4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cpsf1Q9EPU4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cpsf1Q9EPU4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cpsf1Q9EPU4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cpsf1Q9EPU4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cpsf1Q9EPU4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cpsf1Q9EPU4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cpsf1Q9EPU4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cpsf1Q9EPU4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cpsf1Q9EPU4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cpsf1Q9EPU4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cpsf1Q9EPU4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cpsf1Q9EPU4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cpsf1Q9EPU4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms