Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SyncQ9EPM5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SyncQ9EPM5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SyncQ9EPM5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SyncQ9EPM5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SyncQ9EPM5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SyncQ9EPM5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SyncQ9EPM5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SyncQ9EPM5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SyncQ9EPM5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms