Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne8Q9DC53 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne8Q9DC53 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne8Q9DC53 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne8Q9DC53 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne8Q9DC53 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms