Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde1Q9DBZ9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms