Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms