Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf6Q9DBU5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms