Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pop5Q9DB28 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pop5Q9DB28 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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