Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smdt1Q9DB10 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smdt1Q9DB10 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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