Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sgf29Q9DA08 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sgf29Q9DA08 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sgf29Q9DA08 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sgf29Q9DA08 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Sgf29Q9DA08 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sgf29Q9DA08 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sgf29Q9DA08 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sgf29Q9DA08 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms