Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Actrt1Q9D9J3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Actrt1Q9D9J3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms