Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifi35Q9D8C4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifi35Q9D8C4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms