Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnajc4Q9D844 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnajc4Q9D844 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnajc4Q9D844 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnajc4Q9D844 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajc4Q9D844 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnajc4Q9D844 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms