Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm5Q9D806 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm5Q9D806 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms