Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan17Q9D7W4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms